Apresentação - V
Prefácio - VII
1 - MELHORAMENTO DE FRUTEIRAS
2 - ANÁLISE DE VARIÂNCIA: PROGÊNIES, CLONES E MEDIDAS REPETIDAS
2.1 - Experimentação Adequada - 7
2.2 - Teste de Progênie de Meio-Irmãos - 9
2.2.1 - Estimativas de Parâmetros Genéticos e Fenotípicos - 9
2.2.2 - Métodos de Seleção - 13
2.2.3 - Tamanho Efetivo Populacional e Número Efetivo de Famílias Selecionadas - 23
2.3 - Delineamentos Genéticos Clássicos - 26
2.4 - Testes Clonais - 37
2.5 - Medidas Repetidas - 40
3 - ANÁLISE DE DEVIANCE VIA REML/BLUP
3.1 - Avaliação Genotípica e Significância dos Efeitos do Modelo - 47
3.2 - Análise de Deviance - 50
4 - ANÁLISE DE MEDIDAS REPETIDAS EM DELINEAMENTO EXPERIMENTAL
4.1 - Conceitos - 53
4.2 - Eficiência Seletiva e Número de Medições por Indivíduo - 55
4.3 - Avaliação de Várias Colheitas em Experimentos no Delineamento de Blocos ao Acaso - 60
5 - ANÁLISE DE EXPERIMENTOS EM UM LOCAL E COLHEITA
5.1 - Procedimento REML/BLUP – 63
5.2 - Análise de Experimentos em um Local e Safra via REML/BLUP - 65
6 - ANÁLISE DE EXPERIMENTOS EM UM LOCAL E VÁRIAS COLHEITAS
6.1 - Métodos Estatísticos de Análise de Experimentos com Medidas Repetidas - 73
6.2 - Análise de Experimentos em um Local e Várias Safras via REML/BLUP - 76
7 - ANÁLISE DE EXPERIMENTOS EM VÁRIOS LOCAIS E UMA COLHEITA
7.1 - Interação Genótipos x Locais e Métodos Estatísticos de Análise - 79
7.2 - Análise de Experimentos em Vários Locais e uma Safra via REML/BLUP - 85
8 - ANÁLISE DE EXPERIMENTOS EM VÁRIOS LOCAIS E COLHEITAS
8.1 - Análise de Medidas Repetidas em Múltiplos Experimentos - 89
8.2 - Análise de Experimentos em Vários Locais e Várias Safras via REML/BLUP - 93
9 - ANÁLISE DE CRUZAMENTOS DIALÉLICOS E FATORIAIS
9.1 - Delineamentos de Cruzamento - 97
9.2 - Modelo para Análise de Cruzamentos Fatoriais Interpopulacionais com Medidas Repetidas - 98
9.3 - Seleção de Cruzamentos com Alta Capacidade Específica de Combinação - 105
10 - ANÁLISE MULTIVARIADA SIMULTÂNEA DE MÚLTIPLOS CARACTERES, LOCAIS E MEDIDAS REPETIDAS
10.1 - Técnicas de Análise Multivariada - 107
10.2 - Uso Simultâneo das Informações de Múltiplos Locais, Medidas Repetidas e Vários Caracteres - 109
10.2.1 - Aplicação em Bananeira (Musa): Modelos com Efeitos Fixos vs Aleatórios de Genótipos - 109
10.3 - Repetibilidades - 117
10.4 - Seleção Multivariada de Indivíduos (BLUP4) - 120
10.5 - Derivações do BLUP Individual Multivariado - 122
10.6 - Uso de Correlações Parciais nos Índices de Seleção - 129
10.7 - Equações Estruturais - 130
10.8 - Correlação Parcial - 132
10.9 - Equações Estruturais via Metodologia de Modelos Mistos - 132
11 - ANÁLISE DE EXPERIMENTOS COM FRUTEIRAS AUTÓGAMAS
11.1 - Modelo Genético e Componentes de Variação Genotípica - 137
11.2 - BLUP Individual em Espécies Perenes Autógamas - 139
11.3 - Aplicação Prática em Espécies Perenes Autógamas - 140
11.4 - BLUP Individual com Informação de Indivíduo, Família e Genitor, em Espécies Alógamas e Autógamas - 142
11.5 - BLUP Individual Multigerações (BLUP Total) em Espécies Autógamas - 148
12 - DIVERSIDADE GENÉTICA VIA REDES NEURAIS ARTIFICIAIS E MÉTODO DE WARD-MLM
12.1 - Redes Neurais Artificiais - 164
12.2 - Rede de Kohonen - 165
12.3 - Método de Ward-MLM - 167
12.4 - Determinação do Número Ótimo de Grupos - 170
12.5 - Exemplos de Aplicação - 173
13 - ANÁLISE DA INTERAÇÃO PLANTA-PATÓGENO
13.1 - Análise da Interação Planta-Patógeno - 179
13.1.1 - Conceitos - 179
13.2 - Aplicação em Macieira (Malus domestica) - 180
14 - ÍNDICE DE SELEÇÃO
14.1 - Índice de Seleção - 185
14.2 - Índice de Seleção Combinada Multigerações - 195
14.3 - Aproximação para o Cálculo da Acurácia - 201
14.3.1 - Acurácia das Avaliações Genéticas e Número Efetivo de Informações - 201
14.4 - Predição de Valores Fenotípicos Permanentes - 203
14.4.1 - Resposta Correlacionada na Seleção por Valores Fenotípicos Permanentes - 203
14.4.2 - Índice de Seleção para Valores Fenotípicos Permanentes - 205
14.5 - Evolução dos Preditores de Valores Genéticos - 205
14.6 - Composição dos Valores Genéticos de cada Indivíduo - 209
15 - SELEÇÃO GENÔMICA AMPLA (GWS)
15.1 - Conceito de Seleção Genômica Ampla - 211
15.2 - Acurácia da GWS - 215
15.3 - Populações de Estimação, Validação e Seleção - 218
15.4 - População de Validação e Jacknife - 221
15.5 - Métodos Estatísticos na Seleção Genômica Ampla - 221
15.6 - Método RR-BLUP - 227
15.7 - Formas de Parametrização da Matriz de Incidência Genotípica - 231
15.8 - Exemplo via RR-BLUP/GWS - 233
15.9 - Aplicação em Programa de Melhoramento do Maracujazeiro Azedo - 235
15.10 - Acurácia da GWS com Efeitos de Dominância - 239
15.11 - Alocação de Cruzamentos com a Inclusão de Efeitos de Dominância - 241
15.12 - Índice de Seleção via BLUP de Valores Genéticos Tradicionais + Genômicos - 241
15.13 - Parametrização para Marcadores Dominantes (DART, AFLP) - 245
Referências – 253
